В 1941 году из Килемарской школы вышел первый выпуск десятиклассников, в количестве 19 человек.
22 июня 1941 года – воскресный и праздничный день. В 12 часов в Килемарах должен был состоятся праздничный митинг, посвященный 20 – летию автономии Марийской АССР. На площади возле клуба слышалась музыка, играла гармонь, пели песни и частушки. Ничто не предвещало грозы. Раздался звонок. Все хлынули в клуб, уселись. Вдруг на сцену вышел 1 секретарь райкома партии П.А. Рудаков и сообщил о страшной вести – «Война!» Митинг юбилейный сменился митингом антифашистским.
Школа превратилась в приемный пункт; здесь составлялись списки мобилизованных в армию, работала медицинская комиссия. Выпускники Шулев В., Уласов И., Полозов П., Маслов А., Васенин Н., Васенин И., Храмихин А., Зверев М. были призваны в армию. Наши земляки воевали в действующей армии и в партизанских отрядах. Не все вернулись на Родину.
1 сентября за парты в школе сели лишь учащиеся 1-4 классов, остальные работали в колхозе. А в ноябре старшеклассников отправили на оборонительные работы в Козмодемьянск и на ст. Дубовая.
Летом 1943 году на базе школы был организован приют для детей сирот. Воспитывалось здесь 42 человека.
Учителя выходили в деревни и села, разъясняли обстановку на фронте, вселяли надежду.